home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00131 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.0 KB  |  26 lines
  1. ******************
  2. * recA signature *
  3. ******************
  4.  
  5. The bacterial recA protein [1,2,3] is essential for  homologous recombination.
  6. RecA has many functions: it binds to single- and double-stranded DNA, it binds
  7. and hydrolyzes  ATP,  it is also a recombinase and, finally, it interacts with
  8. lexA causing its activation and leading to its autocatalytic cleavage.
  9.  
  10. RecA is  a protein of about 350 amino-acid residues. Its sequence is very well
  11. conserved among  bacterial and cyanobacterial species. As a signature pattern,
  12. we selected  the best conserved region, a nonapeptide located in the middle of
  13. the sequence.
  14.  
  15. -Consensus pattern: A-L-K-F-[FY]-[STA]-[STAD]-[VM]-R
  16. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  17. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  18. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  19.  
  20. [ 1] Smith K.C., Wang T.-C. V.
  21.      BioEssays 10:12-16(1989).
  22. [ 2] Miller R.V., Kokjohn T.A.
  23.      Annu. Rev. Microbiol. 44:365-394(1990).
  24. [ 3] Lloyd A.T., Sharp P.M.
  25.      J. Mol. Evol. 37:399-407(1993).
  26.